MPI

浅学 MPI。

MPI

分布式内存多处理器:

  • 处理器 + 辅助组件 => 节点
  • 一堆节点 => 高性能计算系统
    • 节点 => 进程
  • 节点之间:消息传递

MPI:消息传递接口

安装

还是用 Docker 方便。

宿主机:

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sudo docker run -idt --name openmpi -v /home/openmpi/:/home/openmpi -p 22001:22 alpine

sudo ufw allow 22001 comment 'openmpi:ssh'

sudo docker exec -it openmpi sh

容器内:

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apk add build-base  # 国内网络有时候要多运行几次
apk add perl # Open MPI requires perl
apk add linux-headers # #include <linux/unistd.h>
apk add bash vim
apk add gcompat libstdc++ curl

apk add openssh
vi /etc/ssh/sshd_config # PermitRootLogin yes
passwd # 重新设个 root 密码
/usr/sbin/sshd # 开 ssh 服务后台

# 下载、安装 OpenMPI
wget https://download.open-mpi.org/release/open-mpi/v4.1/openmpi-4.1.4.tar.gz
tar xzf openmpi-4.1.4.tar.gz
cd openmpi-4.1.4
./configure --prefix=/usr/local
make all install

# 测试安装
cd /openmpi-4.1.4/examples/
mpicc -o hello_c hello_c.c
mpirun -n 4 --allow-run-as-root --oversubscribe hello_c
# --allow-run-as-root: root 硬跑
# --oversubscribe: 没有多处理器,单核单线程硬跑

退出来,宿主机,把刚才装好的做成镜像备用,可以方便以后重开:

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sudo docker ps # 找一下刚才那个的 id
sudo docker commit 37c628532bae openmpi:v0.0.0

以后再次搭这个环境就方便了:

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sudo docker run -idt --name openmpi -v /home/openmpi/:/home/openmpi -p 22001:22 openmpi:v0.0.0

# 这个没有 entrypoint,
# 如果要用 ssh,需要手动进去手动开一下 sshd
sudo docker exec -it openmpi-with-sshd sh
容器内 # /usr/sbin/sshd

看着多是由于好多步骤是在弄 SSH,弄好了 SSH,搭集群也就方便了。但我暂时没有兴趣。

MPI 基本命令

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#include <mpi.h>  // 导入包

int main(int argc, char *argv[]) {
MPI_Init(&argc, &argv); // 任意其他 MPI 调用前
...
MPI_Finalize(); // 任意其他 MPI 调用后
...
}

Hello World

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#include <mpi.h>
#include <stdio.h>

int main(int argc, char** argv) {
MPI_Init(&argc, &argv);

printf("Hello, world!\n");

MPI_Finalize();

return 0;
}

编译运行:

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$ mpicc hello.c -o hello
$ mpirun -n 4 --allow-run-as-root --oversubscribe hello
Hello, world!
Hello, world!
Hello, world!
Hello, world!

--allow-run-as-root--oversubscribe 是由于我要强制在单核单线程的虚拟机里用 Docker 里的 root 用户运行 MPI 程序,正常环境上不用。)

通信器

上面的 Hello World:无共享。每个进程做自己的,没有交互,无法协调工作。

MPI 的并发进程交互:通信器(communicator):

  • 地址空间:包含一组 MPI 进程
  • 其他各种属性

MPI 自带提供一个开箱即用的通信器:MPI_COMM_WORLD,包含该 MPI 程序的所有并发进程。

size & rank

sizerank 是两个常用的通信器属性。

  • size:通信器的大小,即构成通信器的进程数量;
  • rank:通信器中每个进程的标识(唯一进程 ID,$\ge 0$ 的整数),称为 rank;

两个属性的 getter(不是 setter):

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int size, rank;

MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, /* out */ &size);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, /* out */ &rank);

(其实这两个函数有 int 类型的返回值,目测成功都是 0。)

e.g. 带 rank 和 size 的 Hello World:

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#include <mpi.h>
#include <stdio.h>

int main(int argc, char** argv) {
MPI_Init(&argc, &argv);

int size, rank;
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);

printf("Hello from rank %d out of %d processes in MPI_COMM_WORLD\n", rank, size);

MPI_Finalize();

return 0;
}

编译运行:

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# mpicc comm.c && mpirun -n 4 --allow-run-as-root --oversubscribe ./a.out
Hello from rank 0 out of 4 processes in MPI_COMM_WORLD
Hello from rank 2 out of 4 processes in MPI_COMM_WORLD
Hello from rank 1 out of 4 processes in MPI_COMM_WORLD
Hello from rank 3 out of 4 processes in MPI_COMM_WORLD

点对点消息

  • MPI 负责管理通信器内的进程之间的数据交换
  • MPI 数据交换的媒介:消息
    • 源进程 rank
    • 目标进程 rank
    • 包含源、目的进程的通信器
    • 标记:区分两个进程间的一组可能的消息,用户自定

发送

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MPI_Send(
/* in */ void* message,
int count, MPI_Datatype datatype,
int dest, int tag, MPI_Comm comm)

发送的消息内容是:从 message 参数处开始的一个 MPI_Datatype[count] 数组

其中,count 是数据元素的数量(数组长度);MPI_Datatype 为其类型,基本就是和 C 的简单数据类型一一对应:

MPI_Datatype 对应的 C 数据类型
MPI_SHORT short int
MPI_INT int
MPI_LONG long int
MPI_LONG_LONG long long int
MPI_UNSIGNED_CHAR unsigned char
MPI_UNSIGNED_SHORT unsigned short int
MPI_UNSIGNED unsigned int
MPI_UNSIGNED_LONG unsigned long int
MPI_UNSIGNED_LONG_LONG unsigned long long int
MPI_FLOAT float
MPI_DOUBLE double
MPI_LONG_DOUBLE long double
MPI_BYTE unsigned char

再次强调,MPI 发送的是数组。单发一个数 int a 也要将其看作 int msg[1] = &a,所以写作 MPI_Send(&a, 1, MPI_INT, ...);而如果要发送一个数组 int A[3],则不必再取地址:MPI_Send(A, 3, MPI_INT, ...)

再次强调,MPI 发送的是数组,理解这点后再去看 MPI 接口,就没那么魔幻了,很多都是「数组首地址 + 长度 + 类型」这三个配套出现,可能有多组这个三元组,例如 MPI_Scatter,后面再加上一个「源/目标进程号 + 通信器」。

接收

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MPI_Recv(
/* out */ void* message,
int count, MPI_Datatype datatype,
int source, int tag, MPI_Comm comm,
MPI_Status* status)

status 就是 source + tag + 可能的 error。

例子

把之前的带 rank 的 hello 改成顺序版本:

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#include <mpi.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <string.h>

int main(int argc, char **argv) {
MPI_Init(&argc, &argv);

int rank, size;
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);

if (size == 1) {
printf("This example requires more than one process to execute.\n");
MPI_Finalize();
exit(1);
}

// 消息收发的参数
int message[2]; // buffer
int dst, src;
int tag = 0;
MPI_Status status;

if (rank != 0) { // 给进程 0 发消息
message[0] = rank;
message[1] = size;

dst = 0;

MPI_Send(message, 2, MPI_INT, dst, tag, MPI_COMM_WORLD);
} else { // 进程 0:顺序收消息
for (src = 1; src < size; src++) {
MPI_Recv(message, 2, MPI_INT, src, MPI_ANY_TAG, MPI_COMM_WORLD, &status);

printf("Hello from process %d out of %d.\n",
message[0], message[1]);
}
}

MPI_Finalize();
return 0;
}

编译运行:

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$ mpicc send-recv.c && mpirun -n 4 --allow-run-as-root --oversubscribe ./a.out
Hello from process 1 out of 4.
Hello from process 2 out of 4.
Hello from process 3 out of 4.

这个程序用上 master-worker 模式了:

  • rank 为 0 的进程是 master,负责顺序收消息、打印;
  • rank 为其他值的进程是 worker,负责发一条消息给 master;
  • if-else 分化 master 和 worker 的工作。

聚合通信

聚合通信:包含通信器内的所有进程的通信模式(群消息)

同步:Barrier

Barrier:栅栏:

  • 所有人都堵在这里等;
  • 所有人都到齐了再放行。

栅(zhà)栏,居然不是读 shān,我说咋老是打不出来。。。另外原来 zhà 栏是这个字啊,从未设想过😭

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MPI_Barrier(MPI_Comm comm)

e.g. 又一个 Hello World:

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#include <mpi.h>
#include <stdio.h>

int main(int argc, char** argv) {
MPI_Init(&argc, &argv);

MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);

int size, rank;
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);

int len;
char name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];
MPI_Get_processor_name(name, &len);

MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);

printf("Hello, world! Process %d of %d on %s\n", rank, size, name);

MPI_Finalize();
return 0;
}

编译运行:

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$ mpicc barrier.c && mpirun -n 4 --allow-run-as-root --oversubscribe ./a.out
Hello, world! Process 0 of 4 on c8e9719000d7
Hello, world! Process 2 of 4 on c8e9719000d7
Hello, world! Process 3 of 4 on c8e9719000d7
Hello, world! Process 1 of 4 on c8e9719000d7

联想:OpenMP 的 barrier 指令

广播:Bcast

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MPI_Bcast(
void *shared_data,
int count, MPI_Datatype datatype,
int root, MPI_Comm comm)

rootshared_data 广播(同步)给各进程的 shared_data 里。

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#include <mpi.h>
#include <stdio.h>

int main(int argc, char** argv) {
MPI_Init(&argc, &argv);

int size, rank;
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);

int A[4];
for (int i = 0; i < 4; i++) {
A[i] = 0;
}

int root = 0; // root process

if (rank == root) {
A[0] = 3;
A[1] = 5;
A[2] = 4;
A[3] = 1;
}

MPI_Bcast(A, 4, MPI_INT, root, MPI_COMM_WORLD);

printf("Rank %d: A = [%d, %d, %d, %d]\n", rank, A[0], A[1], A[2], A[3]);

MPI_Finalize();
return 0;
}

编译运行:

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$ mpicc bcast.c && mpirun -n 4 --allow-run-as-root --oversubscribe ./a.out
Rank 0: A = [3, 5, 4, 1]
Rank 1: A = [3, 5, 4, 1]
Rank 2: A = [3, 5, 4, 1]
Rank 3: A = [3, 5, 4, 1]

分散:Scatter

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MPI_Scatter(
void *send_data, int send_count, MPI_Datatype send_type,
void *recv_data, int recv_count, MPI_Datatype recv_type,
int root, MPI_Comm comm);

rootsend_data 分散到各个进程的 recv_data 里,包括自己的,每个人发 send_count 个。

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#include <mpi.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

int main(int argc, char** argv) {
MPI_Init(&argc, &argv);

int size, rank;
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);

if (size != 4) {
printf("This example requires 4 processes to execute.\n");
MPI_Finalize();
exit(1);
}

int A[4], B[4];
for (int i = 0; i < 4; i++) {
A[i] = 0;
B[i] = 0;
}

int root = 0; // root process

if (rank == root) {
A[0] = 3;
A[1] = 5;
A[2] = 4;
A[3] = 1;
}

MPI_Scatter(A, 1, MPI_INT,
B, 1, MPI_INT,
root, MPI_COMM_WORLD);

printf("Rank %d: A = [%d, %d, %d, %d], B = [%d, %d, %d, %d]\n", rank,
A[0], A[1], A[2], A[3],
B[0], B[1], B[2], B[3]);

MPI_Finalize();
return 0;
}

编译运行:

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$ mpicc scatter.c && mpirun -n 4 --allow-run-as-root --oversubscribe ./a.out
Rank 0: A = [3, 5, 4, 1], B = [3, 0, 0, 0]
Rank 1: A = [0, 0, 0, 0], B = [5, 0, 0, 0]
Rank 2: A = [0, 0, 0, 0], B = [4, 0, 0, 0]
Rank 3: A = [0, 0, 0, 0], B = [1, 0, 0, 0]

收集:Gather

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MPI_Gather(
void *send_data, int send_count, MPI_Datatype send_type,
void *recv_data, int recv_count, MPI_Datatype recv_type,
int dest, MPI_Comm comm);

MPI_Gather 就是做反向的 MPI_Scatter:把各个进程的 send_data 收集到 destrecv_data 里。

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#include <mpi.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

int main(int argc, char** argv) {
MPI_Init(&argc, &argv);

int size, rank;
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);

/* assert size == 4 */

int A[4], B[4];
for (int i = 0; i < 4; i++) {
A[i] = 0;
B[i] = 0;
}

A[0] = rank; // 各自进程的结果

int dest = 0; // 收集到 dest

MPI_Gather(A, 1, MPI_INT,
B, 1, MPI_INT,
dest, MPI_COMM_WORLD);

printf("Rank %d: A = [%d, %d, %d, %d], B = [%d, %d, %d, %d]\n", rank,
A[0], A[1], A[2], A[3],
B[0], B[1], B[2], B[3]);

MPI_Finalize();
return 0;
}

编译运行:

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$ mpicc gather.c && mpirun -n 4 --allow-run-as-root --oversubscribe ./a.out
Rank 0: A = [0, 0, 0, 0], B = [0, 1, 2, 3]
Rank 1: A = [1, 0, 0, 0], B = [0, 0, 0, 0]
Rank 2: A = [2, 0, 0, 0], B = [0, 0, 0, 0]
Rank 3: A = [3, 0, 0, 0], B = [0, 0, 0, 0]

全局收集:Allgather

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MPI_Gather(
void *send_data, int send_count, MPI_Datatype send_type,
void *recv_data, int recv_count, MPI_Datatype recv_type,
MPI_Comm comm);

类似于 MPI_Gather,但是收集的结果是广播到所有进程上的,而不是上缴到 dest(所以也就没这个参数了)。

e.g.

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#include <mpi.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

int main(int argc, char** argv) {
MPI_Init(&argc, &argv);

int size, rank;
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);

/* assert size == 4 */

int A[4], B[4];
for (int i = 0; i < 4; i++) {
A[i] = 0;
B[i] = 0;
}

A[0] = rank; // 各自进程的结果

MPI_Allgather(A, 1, MPI_INT,
B, 1, MPI_INT,
MPI_COMM_WORLD);

printf("Rank %d: A = [%d, %d, %d, %d], B = [%d, %d, %d, %d]\n", rank,
A[0], A[1], A[2], A[3],
B[0], B[1], B[2], B[3]);

MPI_Finalize();
return 0;
}

编译运行:

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$ mpicc allgather.c && mpirun -n 4 --allow-run-as-root --oversubscribe ./a.out
Rank 0: A = [0, 0, 0, 0], B = [0, 1, 2, 3]
Rank 1: A = [1, 0, 0, 0], B = [0, 1, 2, 3]
Rank 2: A = [2, 0, 0, 0], B = [0, 1, 2, 3]
Rank 3: A = [3, 0, 0, 0], B = [0, 1, 2, 3]

规约:Reduce

关于「规约」、「reduce」的词意以及这个过程的示意图,见 OpenMP 的 reduction 指令

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MPI_Reduce(const void *send_data, void *recv_data,
int count, MPI_Datatype datatype,
MPI_Op op,
int dest, MPI_Comm comm);

每个进程发 countdatatype 类型的本地结果 send_datadestdest 将这些结果做 op 运算,结果放到 recv_data

op 可以是:

  • MPI_MAXMPI_MIN
  • MPI_SUMMPI_PROD
  • MPI_LAND(逻辑与)、MPI_BAND(按位与),类似的还有 OR、XOR。要求 datatype 是整型
  • MPI_MAXLOC(最大值其位置)、MPI_MINLOC。要求 datatype 是对:MPI_DOUBLE_INTMPI_2INI

e.g. 计算两个向量的点积:$a \cdot b = \sum_i a_i b_i$:

具体来说就是做这件事:

$$
\begin{array}{rll}
a \cdot b =&\ [\underbrace{1,\cdots,1}_\textrm{100个1},2,\cdots,2,\cdots] \times [2,\cdots,2]^T\
~ =&\ \underbrace{1 \times 2 + \cdots +1 \times 2}_\textrm{100次} +\
~ &\ 2 \times 2 + \cdots + 2 \times 2 +\
~ &\ \cdots
\end{array}
$$

其中,最后一个等号右边每一行由一个进程来算,行之间加起来用 reduce 来做。

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#include <mpi.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

int main(int argc, char **argv) {
MPI_Init(&argc, &argv);

int size, rank;
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);

int local_vector_size = 100;
int global_vector_size = size * local_vector_size;

double *a, *b;
a = (double *) malloc(local_vector_size * sizeof(double));
b = (double *) malloc(local_vector_size * sizeof(double));
for (int i = 0; i < local_vector_size; i++) {
a[i] = 1.0 * rank;
b[i] = 2.0;
}

// 上面都是造数据
// 下面正式开始算 dot product,两阶段:本地累积、全局规约

double partial_sum = 0.0;
for (int i = 0; i < local_vector_size; i++) {
partial_sum += a[i] * b[i];
}

int root = 0;
double sum = 0.0;
MPI_Reduce(&partial_sum, &sum,
1, MPI_DOUBLE, MPI_SUM,
root, MPI_COMM_WORLD);

if (rank == root) {
printf("The dot product is %g\n", sum);
}

free(a);
free(b);

MPI_Finalize();
return 0;
}

编译运行:

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$ mpicc reduce.c && mpirun -n 4 --allow-run-as-root --oversubscribe ./a.out
The dot product is 1200

全局规约:Allreduce

类似于从 MPI_GatherMPI_AllgatherMPI_AllreduceMPI_Reduce 的运算,但是把结果广播到每一个进程(所以也就无需 dest 参数)。

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MPI_Allreduce(const void *send_data, void *recv_data,
int count, MPI_Datatype datatype,
MPI_Op op,
MPI_Comm comm);

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#include <mpi.h>
#include <stdio.h>

int main(int argc, char **argv) {
MPI_Init(&argc, &argv);

int size, rank;
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);

int input = 0;
switch (rank) {
case 0: input = 2; break;
case 1: input = 7; break;
case 2: input = 1; break;
}

int output;
MPI_Allreduce(&input, &output, 1, MPI_INT, MPI_SUM, MPI_COMM_WORLD);

printf("Rank %d: result = %d.\n", rank, output);

MPI_Finalize();
return 0;
}

编译运行:

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$ mpicc allreduce.c && mpirun -n 4 --allow-run-as-root --oversubscribe ./a.out
Rank 3: result = 10.
Rank 1: result = 10.
Rank 2: result = 10.
Rank 0: result = 10.

全局到全局:Alltoall

alltoall 通信模式:

  • 每个发送器也是接收器;
  • 不同的数据被发送到每个接收器:第 i 个数据分区被发送到第 j 个进程;

用每行表示一个进程,每列表示一个数据分区,则 alltoall 的效果类似于矩阵转置:

我的理解是 Alltoall = Allscatter,不知道对不对哈:

  • 作 sender:每个进程把自己的数组 A 做 Scatter 发到各个进程;
  • 作 recver:进程 i 把各个进程发来的数(A[i] from j)按 sender 的 rank j 拼成新数组 B:B[j] = A[i] form j
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MPI_Alltoall(
void *send_data, int send_count, MPI_Datatype send_type,
void *recv_data, int recv_count, MPI_Datatype recv_type,
MPI_Comm comm);

e.g.

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#include <assert.h>
#include <mpi.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <unistd.h>

int main(int argc, char **argv) {
MPI_Init(&argc, &argv);

int size, rank;
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);

assert((size == 4) && "this example is designed for 4 processes.");

int A[4], B[4];

for (int i = 0; i < 4; i++) {
A[i] = i + 1 + 4 * rank;
}

MPI_Alltoall(A, 1, MPI_INT, B, 1, MPI_INT, MPI_COMM_WORLD);

sleep(rank);
printf("Rank %d: A = [%2d, %2d, %2d, %2d], B = [%2d, %2d, %2d, %2d]\n", rank,
A[0], A[1], A[2], A[3],
B[0], B[1], B[2], B[3]);

MPI_Finalize();
return 0;
}

编译运行:

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$ mpicc alltoall.c && mpirun -n 4 --allow-run-as-root --oversubscribe ./a.out
Rank 0: A = [ 1, 2, 3, 4], B = [ 1, 5, 9, 13]
Rank 1: A = [ 5, 6, 7, 8], B = [ 2, 6, 10, 14]
Rank 2: A = [ 9, 10, 11, 12], B = [ 3, 7, 11, 15]
Rank 3: A = [13, 14, 15, 16], B = [ 4, 8, 12, 16]

非阻塞通信

上文的 点对点消息聚合通信 都是阻塞的:发/收 完成之前,函数不会返回。

MPI 还提供了非阻塞的接口:

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MPI_Isend(
void* message,
int count, MPI_Datatype datatype,
int dest, int tag, MPI_Comm comm,
MPI_Request *send_request)

MPI_Irecv(
void* message,
int count, MPI_Datatype datatype,
int source, int tag, MPI_Comm comm,
MPI_Request *recv_request)

// 还有类似的 MPI_Ibarrier, MPI_Ibcast,
// MPI_Iscatter, MPI_Igather
// MPI_Ialltoall, MPI_Iallgather
// MPI_Ireduce, ...

就是函数名 MPI_Xxx -> MPI_Ixxx,参数最后加一个 MPI_Request,用于跟踪该异步通信。这些函数在调用后立即返回。

欲知异步通信是否完成,使用 MPI_Test,把 MPI_Ixxx 的 request 传进来,检查,已完成则置 flag 的值为真:

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MPI_Test(MPI_Request *request, int *flag, MPI_Status *status);

在必须完成异步通信时,使用 MPI_Wait,阻塞,等通信完成:

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MPI_Wait(MPI_Request *request, MPI_Status *status);

用非阻塞通信有一个好处是,可以防呆,避免一些程序顺序瑕疵可能带来的死锁问题。考虑如下程序:

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#include <assert.h>
#include <mpi.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

int main(int argc, char **argv) {
MPI_Init(&argc, &argv);

int rank, size;
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);

assert(size == 2);

int tag = 0;
int a = rank, b = -1;

// work
MPI_Send(&a, 1, MPI_INT, 1 - rank, tag, MPI_COMM_WORLD);
MPI_Recv(&b, 1, MPI_INT, 1 - rank, tag, MPI_COMM_WORLD, MPI_STATUS_IGNORE);

printf("Rank %d: recv value %d.\n", rank, b);

MPI_Finalize();
return 0;
}

send 在前,recv 在后,可以工作。但如果交换二者顺序,就直接死锁(都先 recv,但没人发啊):

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// DEADLOCK!!!
MPI_Recv(&b, 1, MPI_INT, 1 - rank, tag, MPI_COMM_WORLD, MPI_STATUS_IGNORE);
MPI_Send(&a, 1, MPI_INT, 1 - rank, tag, MPI_COMM_WORLD);

改成非阻塞通信:

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#include <assert.h>
#include <mpi.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

int main(int argc, char **argv) {
MPI_Init(&argc, &argv);

int rank, size;
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);

assert(size == 2);

int tag = 0;
MPI_Status status;
MPI_Request send_req, recv_req;

int a = rank, b = -1;

// 可以交换
MPI_Isend(&a, 1, MPI_INT, 1 - rank, tag, MPI_COMM_WORLD, &send_req);
MPI_Irecv(&b, 1, MPI_INT, 1 - rank, tag, MPI_COMM_WORLD, &recv_req);

// 可以交换
MPI_Wait(&send_req, &status);
MPI_Wait(&recv_req, &status);

printf("Rank %d: recv value %d.\n", rank, b);

MPI_Finalize();
return 0;
}

编译运行:

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Rank 0: recv value 1.
Rank 1: recv value 0.

交换 IsendIrecv,程序也正常工作。交换两句 Wait,也正常工作。所以这个就很舒服了。

自定义数据类型

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MPI_Type_create_struct(int count, 
const int array_of_block_lengths[],
const MPI_Aint array_of_displacements[],
const MPI_Datatype array_of_types[],
MPI_Datatype *newtype);

MPI_Type_commit(MPI_Datatype *newtype);

e.g.

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#include <mpi.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

typedef struct {
int x;
double y;
} Pair;

int main(int argc, char **argv) {
MPI_Init(&argc, &argv);

int rank, size;
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);

// 要动态创建的新 mpi 类型
MPI_Datatype mpi_pair;

int nitems = 2; // # fields of Pair
MPI_Datatype types[nitems]; // element types
MPI_Aint offsets[nitems]; // element offsets
int blocklengths[nitems]; // element count

// Pair.x
types[0] = MPI_INT;
offsets[0] = offsetof(Pair, x);
blocklengths[0] = 1;

// Pair.y
types[1] = MPI_DOUBLE;
offsets[1] = offsetof(Pair, y);
blocklengths[1] = 1;

// 注册类型
MPI_Type_create_struct(nitems, blocklengths, offsets, types, &mpi_pair);
MPI_Type_commit(&mpi_pair);

// 然后就可以把 Pair 结构体用 MPI 通信了

int root = 0;

Pair pair;
if (rank == root) {
pair.x = 10;
pair.y = 3.14;
}

MPI_Bcast(&pair, 1, mpi_pair, root, MPI_COMM_WORLD);

printf("Rank %d: recv Pair{x=%d, y=%g}\n", rank, pair.x, pair.y);

MPI_Finalize();
return 0;
}

编译运行:

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$ mpicc newtype.c && mpirun -n 4 --allow-run-as-root --oversubscribe ./a.out
Rank 0: recv Pair{x=10, y=3.14}
Rank 1: recv Pair{x=10, y=3.14}
Rank 3: recv Pair{x=10, y=3.14}
Rank 2: recv Pair{x=10, y=3.14}

参考文献


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